ระบบ DYCP-31DN เป็นระบบอิเล็กโตรโฟรีซิสแนวนอน ในเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสแนวนอน เจลจะถูกหล่อในแนวนอนและจุ่มลงในบัฟเฟอร์ที่ทำงานอยู่ภายในกล่องเจล กล่องเจลแบ่งออกเป็นสองช่อง โดยเจลอะกาโรสจะแยกทั้งสองออกจากกัน ตามที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้ แอโนดจะอยู่ที่ปลายด้านหนึ่ง ในขณะที่แคโทดจะอยู่ที่ปลายอีกด้าน บัฟเฟอร์รันไอออนิกช่วยให้สามารถสร้างการไล่ระดับประจุได้เมื่อมีการจ่ายกระแสไฟ นอกจากนี้ บัฟเฟอร์ยังทำหน้าที่ทำให้เจลเย็นลง ซึ่งจะร้อนขึ้นเมื่อมีการชาร์จ บัฟเฟอร์ที่รันอยู่มักจะหมุนเวียนซ้ำเพื่อป้องกันไม่ให้เกิดการไล่ระดับ pH เรามีหวีหลายขนาดให้เลือก หวีที่แตกต่างกันทำให้ระบบอิเล็กโตรโฟรีซิสแนวนอนนี้เหมาะสำหรับการใช้งานเจลอะกาโรสใดๆ รวมถึงการอิเล็กโทรโฟรีซิสใต้น้ำ สำหรับอิเล็กโตรโฟเรซิสอย่างรวดเร็วด้วยตัวอย่างปริมาณน้อย DNA อิเล็กโตรโฟรีซิสใต้น้ำ สำหรับการระบุ แยก และเตรียม DNA และสำหรับ การวัดน้ำหนักโมเลกุล
ในระหว่างอิเล็กโตรโฟเรซิส เจลจะถูกสร้างขึ้นในถาดหล่อ ถาดประกอบด้วย "หลุม" ขนาดเล็กที่ใช้เก็บอนุภาคที่คุณต้องการทดสอบ สารละลายหลายไมโครลิตร (µL) ที่มีอนุภาคที่คุณต้องการทดสอบจะถูกบรรจุลงในบ่ออย่างระมัดระวัง จากนั้นบัฟเฟอร์ซึ่งนำกระแสไฟฟ้าจะถูกเทลงในห้องอิเล็กโทรโฟรีซิส จากนั้น ถาดหล่อซึ่งมีอนุภาคต่างๆ จะถูกวางอย่างระมัดระวังเข้าไปในห้องและจุ่มลงในบัฟเฟอร์ สุดท้าย ห้องนี้จะปิดและแหล่งพลังงานก็เปิดอยู่ แอโนดและแคโทดที่สร้างขึ้นโดยกระแสไฟฟ้าจะดึงดูดอนุภาคที่มีประจุตรงข้ามกัน อนุภาคจะค่อยๆ เคลื่อนที่ในเจลไปยังประจุตรงข้าม ปิดเครื่องแล้วนำเจลออกมาตรวจสอบ