ระบบอิเล็กโตรโฟรีซิสประกอบด้วยองค์ประกอบหลักสองส่วน: แหล่งจ่ายไฟและห้องอิเล็กโทรโฟรีซิส แหล่งจ่ายไฟจ่ายพลังงาน"พลังงาน" ในกรณีนี้คือไฟฟ้ากระแสไฟฟ้าที่มาจากแหล่งจ่ายไฟจะไหลไปในทิศทางเดียวจากปลายด้านหนึ่งของห้องอิเล็กโตรโฟรีซิสไปยังอีกด้านหนึ่งแคโทดและแอโนดของห้องคือสิ่งที่ดึงดูดอนุภาคที่มีประจุตรงข้ามกัน
ภายในห้องอิเล็กโตรโฟเรซิสมีถาด หรือที่เจาะจงกว่าคือถาดหล่อถาดหล่อประกอบด้วยส่วนต่างๆ ดังต่อไปนี้: แผ่นกระจกที่อยู่ด้านล่างของถาดหล่อเจลจะถูกเก็บไว้ในถาดหล่อ"หวี" ดูเหมือนชื่อ หวีวางอยู่ในช่องด้านข้างของถาดหล่อ โดยใส่ไว้ในช่องก่อนที่จะเทเจลที่ร้อนและละลายลงไปหลังจากที่เจลแข็งตัวแล้ว ให้ถอดหวีออก"ฟัน" ของหวีทำให้เกิดรูเล็กๆ ในเจลที่เราเรียกว่า "เวลส์"บ่อถูกสร้างขึ้นเมื่อเจลที่ละลายร้อนแข็งตัวรอบฟันของหวีหวีจะถูกดึงออกมาหลังจากที่เจลเย็นลงและออกจากบ่อบ่อน้ำเป็นสถานที่สำหรับวางอนุภาคที่คุณต้องการทดสอบบุคคลจะต้องระมัดระวังอย่างยิ่งที่จะไม่รบกวนเจลเมื่อทำการโหลดอนุภาคการแตกหรือทำให้เจลแตกอาจส่งผลต่อผลลัพธ์ของคุณ